「カード手数料」を消費者に負担させることや、現金取引の場合と異なる代金を請求することは、クレジットカード会社の加盟店規約に違反している可能性があり、その場合問題であると考えられます。
「カード手数料」を上乗せされた場合は、明細等でカード手数料が上乗せされたという記録を残し、その決済の内容に規約上の問題がないかクレジットカード会社に確認しましょう。